10×dNTP Primer P1 Primer P2 模板 Taq 酶 5μl 1μl 1μl 1μl 0.5μl 2、设置PCR程序:
94 ℃ 180s 94 ℃ 45s 30 cycles: 55℃ 45s
72 ℃ 60s 72 ℃ 600s 3、运行PCR程序 (二)PCR产物鉴定
反应结束后,取20μl PCR产物进行1.2%琼脂糖电泳分析。
3 .酶切:
(一)质粒DNA酶切
1、 按下表将各种试剂分别加入每个Eppendorf管中,要注意管号。
管号 质粒DNA EcoRⅠ/ μl 酶切Buffer(10×)/ μl ddH2O/ μl RNA酶 ① 10 2 8 ② 10 1 2 7 ③ 10 1 2 6 1 2、 加样后混匀,置于37℃水浴中,保温2小时。然后每个管中加入4 μl
Loading buffer。 (二)琼脂糖凝胶电泳 1、琼脂糖凝胶的制备
称取0.4g琼脂糖加入40ml 0.5×TBE缓冲液中,加热熔解。冷却至65℃时加入2 μl EB,混匀。 2、胶板制备
将凝胶槽洗净擦干,两端用胶布封好,并在一端插好梳子。然后倒入熔好的琼脂糖,待凝胶完全凝固后,去掉两端封条,将凝胶槽移至电泳槽(槽中已加入0.5× TBE缓冲液),拔掉梳子。注意:缓冲液要高出胶面2毫米。 3、 加样
每个样品中加入1/10体积点样缓冲液,混匀后小心地加入样品槽中,要避免相互污染。
4、 电泳观察
接通电源,电压为80V,电泳1小时左右,当溴酚蓝到达下沿1--2㎝处时,停止 泳。
5、 观察及照相
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将胶板拿出,用自来水小心地冲洗一下。在紫外灯下观察结果,如果有条件也可用凝胶成像系统照相。
四.实验结果与分析
1.质粒DNA提取与电泳检测结果
上图所示,为第一次提取的质粒DNA产物,上排为GFP,下排为P38;
上排第一个,下排两个胶的第一个均为MARKER,由于在点样过程中,部分同学将P38加在第一排,故导致GFP条带的颜色很深。
由上图可以看出,只有少数P38提取较成功,主要由于提取过程中菌体用量较少。
上图为第二次提取的P38检测结果,因此次菌体的浓度比首次提取所用的大得多,所以条带颜色明显较深,且位于同一直线上。
2. PCR结果:
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由上图可知,PCR扩增效果较好。
左边的第一条带为MARKER,后面PCR的产物。
由于第13个孔在点样时遗漏,故无条带产生,而其他的颜色都较亮,且PCR产物都位居同一条线上。因为引物M13F和M13R中间的产物呈指数扩增,故分析可知,中间最亮条带的即为M13F和M13R之间的产物。
3.酶切后的电泳检测结果:
由上图知,第一条带为MARKER, 之后为P38的酶切结果。
若无RNA,图像为两条带,下为DNA,上酶蛋白,而10的那个则是没有加RNase
GFP和TA克隆的转化和观察
一.目的
掌握感受态细胞制备和转化的基本方法。
二.原理
受体细胞经过一些特殊方法如电击法, 化学试剂法(CaCl2 ,RbCl,KCl)等的处理后,细胞膜的通透性发生了暂时性的改变,成为能允许外源DNA分子进入的感受态细胞。
三.步骤
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·感受态细胞的制备(0.1M CaCl2方法)
1、 从LB固体平板挑单克隆于5ml LB液体培养基中(不加抗生素),
37℃×200rpm×12-16h,可过夜培养。
2、 将活化菌体按1`~5%接种到LB中,扩大培养37℃×200rpm×2h,至OD600约为0.4。 3、 取培养好的菌液1.5 ml于一离心管中,4℃ 离心8 000rpm×1 min。
4、 弃上清,加500 ul 0.1M CaCl2 (灭菌预冷)洗菌体,4℃冷冻离心8000rpm×1 min。 5、 彻底除去残液, 加200 ul 0.1M CaCl2 (灭菌预冷),悬浮菌体。 6、 冰浴静置 30 min ,4℃冷冻离心8000rpm×1 min。
7、 弃上清,加100 ul 0.1M CaCl2 (灭菌预冷),悬浮菌体,即为制备好的感受态细胞。
附注:
①、 整个过程注意无菌操作和保持低温。
②、 培养物处于对数生长期是制备感受态细胞的关键。
③、 如果要求高转化效率,不建议使用简单深冻保存的感受态细胞。
④、 LB液体培养基建议用不加抗生素和加抗生素的两种培养基,检查菌体是否污染。 ⑤、 D600值指细胞密度,用于判断培养物是否处于对数生长期。OD600值在0.4 - 0.5时,
此时培养物处于对数生长期,细胞数在20min内加倍。
。质粒对大肠杆菌的转化
1、将连接产物加入100 ul制备好的感受态细胞,冰上放置30 min。 2、42℃热激90S。 3、迅速冰浴3min。
4、加入300 ul LB液体培养基,37℃轻摇培养45min。 5、加入30 ul X-gal和6 ul IPTG,混匀。
6、取100 ul涂布在含有50 ug/ml氨苄的LB固体培养基中。 7、37℃倒置,避光培养16-20 h。
8、蓝白斑筛选,挑取单菌落进行菌落PCR鉴定。
四.结果与分析
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