生 物 化 学 实 验 讲义
实验十一、紫外吸收法测定核酸的含量
一.实验目的
学习紫外分光光度法测定核酸含量的原理和操作方法,熟悉紫外分光光度计的基本原理和使用方法。 二.实验原理
核酸、核苷酸及其衍生物的分子结构中的嘌呤、嘧啶碱基具有共轭双健系统(-C=C一C=C一),能够强烈吸收250~280nm波长的紫外光。核酸(DNA,RNA)的最大紫外吸收值在260nm处。遵照Lambert-Beer定律,可以从紫外光吸收值的变化来测定核酸物质的含量。 在不同pH溶液中嘌呤、嘧啶碱基互变异构的情况不同,紫外吸收光也随之表现出明显的差异,它们的摩尔消光系数也随之不同。所以,在测定核酸物质时均应在固定的pH溶液中进行。
采用紫外分光光度法测定核酸含量时,通常规定:在260nm波长下,浓度为1μg/mL的 DNA溶液其光密度为0.020,而浓度为1μg/mL的RNA溶液其光密度为0.022。因此,测定未知浓度的DNA(RNA)溶液的光密度OD260nm,即可计算测出其中核酸的含量。
该法简单、快速、灵敏度高,如核酸3μg/mL的含量即可测出。对于含有微量蛋白质和核苷酸等吸收紫外光物质的核酸样品,测定误差较小,若样品内混杂有大量的上述吸收紫外光物质,测定误差较大,应设法事先除去。
由于降解或水解作用,核酸的光密度可以增高约40%,这就是众所周知的增色效应(hyperchromic effect)。在大分子的核酸中,氢键和π-键相互作用改变了碱基的共振行为。因此,核酸的光密度低于构成它的核苷酸的光密度,该现象称为减色效应(hypochromic effect)。 三、实验器材
1.试材:核酸样品DNA或RNA。 2. 主要仪器
(1)分析天平 (2)紫外分光光度计 (3)冰浴或冰箱 (4)离心机 (5)离心管(10mL) (6)烧杯(10mL) (7)容量瓶(50mL、100mL) (8)移液管(0.5ml、2mL和5mL) (9)药品勺和玻璃棒 (10)试管和试管架。 四、试剂
(1)5%~6%氨水:用25%~30%氨水稀释5倍。
(2)钼酸铵-过氯酸试剂:取3.6mL70%过氯酸和0.25g钼酸铵溶于96.4mL蒸馏水中。
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五、操作步骤
1.核酸样品纯度的测定
(1)准确称取待测的核酸样品0.5g,加少量蒸馏水(或无离子水)调成糊状,再加适量的水,用5%~6%氨水调至pH7,定容至50mL。
(2)取两支离心管,甲管内加入2mL样品溶液和2mL蒸馏水;乙管内加入2mL样品溶液和2mL沉淀剂(沉淀除去大分子核酸,作为对照)。混匀,在冰浴(或冰箱)中放置30min,3 000r/min离心10min。从甲、乙两管中分别取0.5mL上清液,用蒸馏水定容至50mL。选用光程为1cm的石英比色杯,在260nm波长下测其光密度。
(3)计算
如果待测的核酸样品不含酸溶性核苷酸或可透析的低聚多核苷酸,则可将样品配制成一定浓度的溶液(20~50μg/mL)在紫外分光光度计上直接测定。
2.核酸溶液含量的测定
当待测的核酸样品中含有酸溶性核苷酸或可透析的低聚多核苷酸,在测定时需要加钼酸铵-过氯酸沉淀剂,沉淀除去大分子核酸,测定上清液260 nm处光密度作为对照。
(1)取2支离心管,每管各加入2mL待测的核酸溶液,再向甲管内加2mL蒸馏水,向乙管内加2mL沉淀剂。混匀,在冰浴(或冰箱)中放置10min,3 000r/min离心10min。将甲、乙两管清液分别稀释至光密度在0.1~1.0之间。选用光程为1cm的石英比色杯,在260nm波长下测其光密度OD260nm。
(2)计算
六、结果讨论
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1.采用紫外光吸收法测定样品的核酸含量,有何优点及缺点?
用紫外光吸收法测定样品的核酸含量,具有简单、快速、灵敏度高的优点,并且待测核酸样品中含有的微量蛋白质和核苷酸等吸收紫外光物质,产生较小测定误差。但该法在测定样品内混杂有大量的上述吸收紫外光物质时,则会产生较大测定误差,需要设法事先除去。 2.若样品中含有核苷酸类杂质,应如何校正?
当样品中含有核苷酸类杂质时,需要加钼酸铵-过氯酸沉淀剂处理,沉淀除去大分子核酸,测定上清液260 nm处光密度,以此作为对照;再从未加沉淀剂测得的样品液260nm光密度中扣除。
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实验十二、化学法测定DNA的含量——二苯胺显色法
一、实验目的
学习利用二苯胺显色法测定DNA的含量的原理和操作
二、实验原理
DNA在酸性条件下加热,其嘌呤碱与脱氧核糖间的糖苷键断裂,生成嘌呤碱、脱氧核糖和脱氧嘧啶核苷酸,而2-脱氧核糖在酸性环境中加热脱水生成ω-羟基-γ-酮基戊糖,与二苯胺试剂反应生成蓝色物质,在595nm波长处有最大吸收。DNA在40~400μg范围内,光吸收与DNA的浓度成正比。在反应液中加入少量乙醛,可以提高反应灵敏度。
三、实验器材
1.分光光度计 2.烧杯 3.试管 4. 玻璃棒 四、试剂
1. DNA标准溶液
准确称取小牛胸腺的DNA钠盐,以0.01mol/L NaOH溶液配成200μg/mL的溶液。 2. 测定样品溶液
准确称取干燥的DNA制品,以0.01mol/L NaOH溶液配成100~150μg/mL的溶液。若要测定RNA制品中的DNA含量,样品中至少要含有DNA 20μg/mL 才能进行测定。
3. 二苯胺试剂
称取1g二苯胺, 溶于100mL的分析纯的冰乙酸中,再加入60%以上的过氯酸10mL,混匀待用。临用前加入1mL的1.6%乙醛,配好的试剂应为无色。 五、操作步骤
1. 制作DNA标准曲线:取12支洁净干燥试管按表1加入试剂:
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