然后在该序列5’端上添加数个碱基作为保护碱基。点击完成。 △下游引物设计相同,不再赘述。
2.突变引物绘制:在目的基因上截取一小段包含要突变位点的序列,点击
Primers→Add primers,为该引物命名,在5’序列突变位点的三个碱基画黑,如图:
点击Insertions,选择突变成的氨基酸,点击Insert。即可获得该突变引物,点击Reverse Complement,可获得反向引物。 六、模拟标准限制性克隆
1.打开被插入片段的质粒图谱,选择合适的两个酶切位点,如HindIII和ApaI,如图:
点击Actions→Insert Fragment,点击HindIII+键盘Shift键+ApaI,点击Insert,在source of fragment处选择插入的目的片段来源。点击上述同样的酶,给该重组质粒命名,点击clone。 七、 模拟融合克隆
1. 打开一个需要插入片段质粒图谱,点击Actions→Insert One Fragments,弹出以下窗口:
2. 点击sequence,找到想要发生替换的位点。
3. 点击Fragment,在Source of Fragment处选择替换片段的另外一个质粒图谱。此时弹出另外一个质粒图谱图样。
4. 点击用于替换的片段,观察该片段阅读方向与被替换质粒位点的方向是否一致,如不一致,点击
更换方向。
5. 选择后,点击Product,点击Choose Overlapping PCR Primers,此时即形成融合后的质粒图谱。
6.若想获得引物的序列,点击Primers→Export Selected Primers,选择保存。