题型: 名词解释 分析题 简答题 问答题
Genes perform three major roles:
1. Replicated faithfully
Chapter 2 DNA Replication: Mechanism and Enzymology
(1) 掌握DNA和RNA在结构上和功能上的异同,并能够解释为什么DNA分
子上需要用T代替U以及用脱氧核糖代替核糖。
(2) 掌握DNA双螺旋结构的主要内容、支持DNA双螺旋结构的主要实验证
据及其生物学意义;了解大沟对于DNA与蛋白质相互作用的重要性。 (3) 掌握A型、B型和Z型双螺旋结构之间的异同以及形成A型和Z型双螺
旋所需要的条件。
(4) 能够画出AT、AU和GC碱基对之间的氢键。
(5) 掌握DNA的正超螺旋和负超螺旋形成的原因;能够使用L=T+W预测DNA
过度缠绕或缠绕不足的后果;知道何种超螺旋有利于DNA复制和转录。 (6) 了解DNA的变性、复性及其杂交等性质;知道能够影响DNA变性和复
性的各种因素。
(7) 了解影响DNA的Tm的各种因素。
(8) 掌握DNA复制的一般性质,包括半保留复制、具有固定的起点、需要引
物、模板需要解链、复制方向总是从5'→3'、半不连续复制、通常是双向复制和具有高度的忠实性等。
(9) 了解由Stahl和Meselson设计的证明DNA进行半保留复制的实验思路和
具体过程;掌握如何证明DNA复制的方向总是从5'→3'以及如何确定一个DNA分子进行双向复制还是单向复制的方法及原理;了解脉冲标记和脉冲追踪实验的原理以及如何用它们证明DNA复制的半不连续性。
(10) 了解以大肠杆菌为代表的五种原核细胞DNA聚合酶(DNA聚合酶工、Ⅱ、
Ⅲ、Ⅳ和V)的结构及其功能分工;知道DNA聚合酶Ⅲ是催化大肠杆菌染色体DNA复制的主要聚合酶以及支持这种说法的证据。
(11) 了解DNA聚合酶工所具有的5'-外切核酸酶(简称外切酶)活性和绝大多数
DNA聚合酶所具有的3'一外切酶活性的生理意义;了解DNA聚合酶(Klenow酶)的三维结构与其功能之间的关系;掌握DNA聚合酶如何在聚合酶活性和校对活性之间进行切换。
(12) 了解真核细胞五种主要的DNA聚合酶(DNA聚合酶αβγδ和ξ)的结构
及其功能分工,以及新近发现的一些易错的DNA聚合酶(如DNA聚合酶δεζ)在DNA跨损伤合成中的作用;知道DNA聚合酶α、δ和ε是催化真核细胞染色体DNA复制的主要聚合酶;了解DNA聚合酶Ⅲ和DNA聚合酶δ所具 有的高进行性的原因。
(13) 掌握DNA聚合酶以外的其他蛋白质或酶(DNA解链酶、单链结合蛋白、
引发酶、DNA拓扑异构酶、DNA连接酶、端粒酶等)在DNA复制中的作用。 (14) 了解原核系统复制子和真核系统复制子的类型及其异同;了解复制起始
区和双向复制之间的关系;知道每一个双向复制的复制泡具有两个复制叉,每一个复制叉含有一个前导链和一个后随链。
(15) 了解大肠杆菌DNA复制四个阶段的反应;了解大肠杆菌染色体DNA复
制的详细机制,并能够利用双聚合酶(二聚体)模型解释一个复制叉内的前导链和后随链如何同时进行复制;能够利用招募解释在复制起始区如何形成预引发体的结构。
(16) 了解terE、D、A和terC、B是如何一起终止大肠杆菌DNA复制的。 (17) 了解Dam甲基化酶在大肠杆菌DNA复制中的作用。
(18) 了解真核DNA复制系统与原核复制系统的主要差别;了解SV40体外复
制系统大概的复制过程以及T抗原,RFC(复制因子C),RPA(复制蛋白A),FEN—1(翼式核酸酶),增殖细胞核抗原(PCNA),DNA,聚合酶αδ和ε等在复制中所起的作用。
(19) 了解自主复制序列(ARS)的结构以及ARS、起始点识别复合物(ORC)、
执照因子(licensing fac-tor)、Cdc6和MCM(微小染色体维持蛋白)复合物之间
的关系。
(20) 了解克服线性DNA未端复制问题的四种方法,特别是端粒酶在克服真细
胞染色体DNA未端复制问题中所起的作用。 (21) 了解滚环复制和D环复制的基本过程及其功能。
(22) 了解实现DNA复制的高度忠实性的五种机制并能解释DNA复制为什么
需要RNA引物以及DNA复制方向为什么总是从5'→3'。
2. Accumulate mutations thereby allowing evolution
Chapter 3 DNA Damage and repair Chapter 4 Transposition
(1) 掌握DNA重组的定义、类型及其生物学功能。
(2) 能够区分解释同源重组的Holliday模型、单链断裂模型和双链断裂模型。 (3) 了解RecA蛋白、RecBCD蛋白、RuvABC蛋白的结构和功能以及它们在大
肠杆菌RecBCD同源重组途芦中的作用。 (4) 掌握位点特异性重组与同源重组的差别。
(5) 了解attP位点、attB位点、整合酶和整合宿主因子(1HF)在入噬菌体在:
进行位点特异性重组过程中的作用;了解整合酶与DNA拓扑异构酶工之间的异伺点。
(6) 掌握转座重组的类型及其功能;认识以下几种常见的真核生物‘的转座
子:Ac—Ds元件、户元件、Ty元件、Copia元件、SINE和LINE;能够区分逆转座:子与DNA转座子、自主型转座子与非自主型转座子与逆转录病毒之间的关系。
(7) 掌握以下名词的定义或含义:嘧啶二聚体、直接修复、碱基切除修复
(baseexcision此pa汀,BER)、核苷酸切除修复(nucleotide excisionrepair;,NER)、错配修复、跨损伤合成(translesionDNA synthesis TLS)SOS修复、转录偶联修复(TCR)、易错修复二无嘌呤嘧啶(AP)位点、类变子(mutator)。 (8) 了解导致DNA损伤的主要理化因素以及常见的DNA损伤。
(9) 知道DNA是细胞内唯一一种受到损伤以后可以完全被修复的分子;了解
DNA损伤能够完全被修复与DNA双螺旋结构之间的关系。
(10) 了解DNA损伤修复的几种主要机制以及大致的修复过程;能够区分直接
修复和切除修复以及易错修复;能够区分碱基切除修复与核苷酸切除修复、全局性核苷酸;切除修复和转录偶联核苷酸切除修复、短修补合成与长修补合成;了解切除修复四个;阶段的反应。 · ·
(11) 掌握大肠杆菌在错配修复中识别子链和母链的分子机制;能够预痢Dam
甲基化酶的缺陷对错配修复的影响。
(12) 30、了解一些与修复缺陷有关的遗传性疾病(如着色-J隆干皮病)。 (13) 了解以下名词的定义或含义:点突变、移码突变、转换(transition)、颠换
(订ansvefsion)、无义突变(nOnsensemutation)、错义突变(missensemutation)、沉默突变(silentmutation)、自发突变、诱发突变、突变原、回复突变、校正突变(suppressormutation)。
(14) 掌握修复缺陷与突变之间的关系;了解突变的各种因素以及各种突变原
叛‘变的分子机制。
(15) 区分显性突变和隐性突变、基因内校正和基因间校正。
(16) 了解IS如何导致靶点序列重复的;能够区分插入序列、复杂性转座子和
复合型攻座子。
3. Direct the production of RNAs and proteins
Chapter 5 Transcription
(1) 掌握DNA转录与DNA复制之间的异同。
(2) 知道写出的启动子序列和一个基因的序列都是来自这个基因在DNA上的
编码链。
(3) 了解DNA聚合酶与RNA聚合酶之间的异同;·掌握以大肠杆菌为代表的
原核细胞RNA聚合酶全酶的结构以及各亚基在功能上的分工;了解利福霉素和利链霉素对原核生物RNA聚合酶的抑制。
(4) 了解ζ因子的结合如何影响原核细胞RNA聚合酶与启动子之间的亲和
性。
(5) 了解原核生物启动子的一致序列以及一10区与-35区之间的间隔距离对
启动子本身的重要性。
(6) 了解强启动子和弱启动子之间的差别;能够预测启动子发生的突变对转